最新更新
Lasergene 18.0版发布
我们很高兴地宣布Lasergene 18现在可以下载了。
此版本带来了重要的新特性和改进的功能，包括对 GenVision Pro 的重大更新，这是我们用于可视化和分析多个样本基因组数据的应用程序。Lasergene 18 的新功能包括：
我们当前的安装程序还包含对以下影响 SeqBuilder Pro 的已知问题的修复：
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分阶段变异分析
Lasergene Genomics现在包括一种二倍体定相算法，用于分析与完整人类基因组一样大的长读长数据集。
- 只需选择新的变异检测选项，即可在SeqMan NGen中开始分阶段单倍型工作流程。
- 在GenVision Pro的新基因组视图中查看组装后整个基因组的分相/非分相区域。
- 使用 GenVision Pro 中的几个新轨迹和选项，可视化和分析相位对齐读数、相位块、相位一致性和相位变体。
- 导出分阶段共识块以获取目标基因的母系和父系单倍体序列。
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多个实验的变异比较
GenVision Pro现在提供了全面比较多个实验的变异的功能。
- 将 SeqMan NGen 组件、BAM 和/或 VCF 文件导入 GenVision Pro。
- 根据维恩图、单个或多个基线对照、成对样本（例如，正常与肿瘤）、包含该变异的样本或对的最小百分比以及许多其他选项过滤变异。保存过滤器或将其设置为将来项目的默认过滤器。
- 查看在 SeqMan NGen 中组装的人类样品的Variant Annotation Database信息。
- 创建变体集，并将其与维恩图、并集、交集或包含每个变体的集合的最小百分比进行比较。
- 将变体和变体集导出为 CSV 或制表符分隔的文本文件。
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基因集富集分析 （GSEA）
GSEA 是RNA-Seq差异表达工作流程的专门版本，专注于具有某些共同点的基因组，例如调控、染色体位置或生物学功能。
- 当满足 DESEQ2 或 EdgeR 分析的标准时，在 SeqMan NGen 中访问 GSEA 计算方法。
- 了解一组预定义的基因是否在两种生物状态（例如，表型）之间显示出统计学上的显著差异。
- 从 31 种人类、19 种小鼠、秀丽隐杆线虫和酵母分析选项中选择任意一个。
- 在专门的气泡图中查看输出，该气泡图列出了所选分析集中同样差异表达的基因，并在显示上调和下调基因集的聚类图中查看输出。
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Golden Gate Cloning
SeqBuilder Pro 现在支持 Golden Gate 虚拟克隆，以实现精确和无疤痕的克隆。
- 使用一个简单的向导设置克隆，该向导可以检测可能的故障并提供有用的反馈。
- 查看克隆的所有组件的功能。
- 轻松删除不需要的限制性位点（驯化）。
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使用 IQ Tree
构建的系统发育树MegAlign Pro现在包括用于构建系统发育树的 IQ Tree 算法。这种广泛使用的最大似然法快速、准确，并支持自举。
- 从 4 种可用的系统发育计算方法中选择 IQ-Tree。
- 生成并比较由不同方法创建的多个树。
- 自定义和导出您的系统发育树，以便发布或协作。
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