上海卡贝信息技术有限公司

 

Sequencher

下一代DNA测序(NGS)

当前版本:5.4.6

Sequencher通过将最新的经过同行评审的NGS算法从命令行带入直观的点击界面,增强了桌面科学家的能力。无论是执行参考引导的比对,de novo组装,变体调用或SNP分析,Sequencher都有您需要的工具来获得结果。 Sequencher集成了全面的Cufflinks套件,可对您的RNA-Seq数据进行深入的转录本分析和差异基因表达。 Sequencher可以使用自定义图和图表轻松生成RNA-Seq数据的独特可视化效果,从而在几秒钟内为您提供可随时发布的图形。

SANGER DNA分析


Sequencher广泛的Sanger分析功能是其基础。 从头到尾可自定义,没有其他程序可以为您提供像Sequencher一样强大的功能。 拥有经过25年磨练的易于使用的界面,初次使用的用户在几分钟之内就会感觉像专业人士。 从修整读取,自定义装配和对齐算法,变量表,摘要报告,注释等所有内容; 这个清单不胜枚举。 快来看看为什么Sequencher已在成千上万的研究文章和同行评审的期刊上发表。 简单而强大。

 

     

 

Sequencher 5.4.6已经发布!

所有DNA序列分析的新增功能和增强功能。

Sanger:

  • 将来自Sequencher Connections中的Primer-BLAST运行的引物对序列发送到您的Sequencher项目。
  • 轻松使用“项目窗口”中的共有序列作为混合测序项目的NGS比对的参考序列。
  • 新的批量还原修剪结束命令。
  • 能够在项目窗口中调整字体大小。

NGS:

  • 更快的GSNAP和BWA-MEM工作流程。
  • 建立可重复用于与整个基因组比对的GSNAP数据库和BWA索引。
  • 使用FastQC报告查看和保存NGS原始数据文件的质量得分和元数据。
  • 生成变体调用文件(VCF),以使用SAMtools标记NGS序列中的变体。

RNA-Seq:

  • 扩展了Cufflinks套件,增加了Cufflinks和Cuffnorm。
  • Cuffdiff和Cuffnorm的唯一条件和重复项编辑器。
  • 具有自定义排序和过滤选项的增强型RNA-Seq可视化效果。
  • 使用增强的外部数据浏览器轻松管理所有DNA-Seq和RNA-Seq项目。

 

下载试用

要获得15天的免费评估许可证或将Sequencher版本更新到5.4.6,请遵循以下四个简单的步骤。这将为您的DNA测序提供完整的Sanger 和NGS功能。

 

步骤1:下载SEQUENCHER

下载Sequencher for Windows 下载Sequencher for Mac

步骤2:下载DNA-SEQ TOOLS

下载DNA-Seq Tools for Windows 下载DNA-Seq Tools for Mac
注意:GSNAP仅支持64位的Sequencher 5.4或更高版本。

步骤3:下载RNA-SEQ TOOLS

下载RNA-Seq Tools for Windows 下载RNASeq Tools for Mac

步骤4:下载FASTQC

下载FastQC 下载FastQC
注意:运行FastQC需要Java 1.6或更高版本。要下载Java,请访问: java.com

都完成了! 祝贺您-您已经准备好开始使用Sequencher了!

安装说明

有关在Windows或Macintosh上安装Sequencher的帮助:

Sequencher安装说明

Mac Sequencher安装(PDF)

PC Sequencher安装(PDF)

 

DNA-Seq Tools安装说明

DNA-Seq Tools安装(PDF)

 

RNA-Seq Tools安装说明

RNA-Seq Tools安装(PDF)

 

系统需求

Macintosh最低要求:

10.7及更高版本
3 GB内存(处理NGS数据需要更多内存,建议至少16 GB。大型数据集可能需要额外的RAM。)
355 MB硬盘空间用于Sanger DNA分析,另外320 MBs用于NGS测序分析

注意

Sequencher 5.4.6与macOS Catalina(10.15)不兼容。 为了继续使用Sequencher 5.4.6,请暂时不要升级Mac OS。 新的完全兼容版本发布后,我们将发送电子邮件更新。 我们知道,这些不可预见的延迟给我们的Mac用户带来了新的挑战,我们希望积极为受影响的人们提供解决方案。 如果由于升级到Catalina或Big Sur而失去了获得Sequencher许可证的权限,请告知我们,我们将努力提供解决方案。

 

Windows最低要求:

Windows 8及更高版本
3 GB内存(处理NGS数据需要更多内存,建议至少16 GB。大型数据集可能需要额外的RAM。)
280 MB硬盘空间用于Sanger DNA分析,另外580 MB用于NGS测序分析

教程

有关如何使用Sequencer执行关键任务的信息,以及如何使用sequencer的许多新功能的说明,请浏览在线教程。

 

注意:要阅读Sequencer 5.4. 6 EULA,请点击这里。此外,请注意Sequencer 5.4.6 EULA可能会随时更改,完全由Gene  Codes自行决定。

 


 

 

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尊敬的客户朋友,如您有任何意见建议,请通过下表反馈给我们,我们会尽快与您联系。

 

 

 

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