PERMANOVA+插件
用于处理更复杂的采样结构,实验设计和模型
你努力设计好你的学习。 现在充分利用它。
PERMANOVA +为您提供了经典线性模型的所有优点,但却留下了假设。
PERMANOVA +是PRIMER v7的附加软件包,它扩展了基于相似性的方法,可以分析多变量(或单变量)数据,以响应多因素抽样设计,复杂实验和/或梯度。 数据云直接在所选相似度量的空间中建模,保留了基本的灵活性。 通过准确构建相关的测试统计数据和复杂的置换算法,实现正式推理,使其无需分发。 你所要做的就是了解你的设计; PERMANOVA +为您完成所有艰难的工作。
PERMANOVA+
复杂设计分析的前沿
- 多因素方差分析、ANCOVA 设计或多响应数据的多元回归模型。
- 基于相似性度量进行分析,或选择欧几里得距离以获得经典结果。
- 测试统计数据是通过对设计和逻辑细节的谨慎关注来计算的。
- 通过高级排列技术获得的所有 p 值,可提供您可以信赖的强大、严谨、无分布的结果。
- 在 PRIMER v7 Windows 环境中无缝集成。
- 用于多元分析的复杂方法以及您已经喜欢的 PRIMER 中的所有数据处理和可视化工具。
PERMANOVA
- 基于选择的相似矩阵对多元数据进行直接分区。
- 多因素设计、交互作用、固定或随机因素、嵌套或交叉、不对称。
- 自动识别给定设计中隐含的所有项,并能够合并或删除项。
- 基于均方 (EMS) 的预期构建的检验统计量。
- 置换算法允许多级设计并考虑模型中的其他项。
- 成对比较和用户指定的对比。
效应大小/方差分量的估计。
- 质心之间的距离揭示了阶乘结构中的显著模式。
- 不平衡或非重复设计(分裂图、随机区组等); 选择SS的类型。
PERMDISP
根据任何相似性度量测试组内多元分散的同质性。
作为 PERMANOVA 的完美补充,PERMDISP 专注于可变性——点在不同组中的“分布”程度。
非常适合研究自然系统中的生态贝塔多样性或遗传变异。
DISTLM / dbRDA
找出一个或多个解释变量解释了多变量数据云中的多少变化。
基于不同的多元多元回归分析在这里完成:
- 单个回归量的边际和顺序排列测试;
- 使用向前、向后、逐步或“最佳”方法进行变量选择;
- 用于模型比较的信息标准(AIC、AICc、BIC、调整后的 R2)的多变量类似物;
- 分组或单独分析变量集;
- 使用基于差异的冗余分析 (dbRDA) 排序可视化拟合值。
CAP
使用主坐标 (CAP) 的规范分析在所选相似性度量的空间中执行判别分析。
留一法交叉验证给出了先验组独特性的统计测量。
将新样本分配到现有组,或沿连续梯度预测新样本的位置。
非常适合环境监测程序、特征的形态分析或使用新数据验证聚类结果。
探索欧几里得空间中两组变量之间的相互关系,或通过使用典型相关方法的相异性度量。
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